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基因数据处理70之Picard安装没成功

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：148

1.下载： https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装： hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK[详细]
OBIEE RPD开发

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-07 热度：200

A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrenc[详细]
推荐系统技术之文本相似性计算（三）

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：162

副标题#e# 今天这篇也比较长，但中间有部分是代码，7，8，9最后三节的信息我认为较为有用。前面说了两篇了，推荐系统技术之文本相似性计算（一）和推荐系统技术 --- 文本相似性计算（二）分别介绍了 TFIDF 和向量空间的相关东西，然后介绍了主题模型，这[详细]
??攻略｜13招神技让你在数据科学和数据分析工作中脱颖而出

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：148

副标题#e# 简介：我有幸在很早参与了一个大数据科学项目，我非常喜欢其中的工作，甚至我意识到我的努力可以增加一些公司的价值。然而，可悲的是，只有不到30%的数据科学项目最终实施了。我备受打击的意识到我的努力被浪费了。但是，我不是唯一的一个。几乎[详细]
基因数据处理46之cloud-scale-bwamem安装（compile.pl安装没问题

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：169

版本：https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem/releases/tag/v0.2.1 1.需要设置spark路径： !--systemPath/cluster/spark/spark-1.3.1-bin-hadoop2.4/lib/spark-assembly-1.3.1-hadoop2.4.0.jar/systemPath -- systemPath/home/hadoop/cloud/sp[详细]
基因数据处理44之cloud-scale-bwamem安装

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：92

cloud-scale-bwamem是在spark等云环境上实现bwa-mem算法，加速对全基因组匹配的处理 1.下载： git clone https://github.com/ytchen0323/cloud-scale-bwamem.git 2.编译： mvn clean package 3.编译成功： [INFO] ---------------------------------------[详细]
基因数据处理50之cs-bwamem、bwa、snap、bwa-mem与art比较

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：61

副标题#e# 直接看结果：（1）art仿真数据： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ cat G38L100c50Nhs20.aln ##ART_Illumina read_length 100@CM art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -c 50 -o G38L100c50Nhs20[详细]
基因数据处理45之cloud-scale-bwamem安装（compile.pl安装有问题

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：126

脚本： hadoop@Master:~/xubo/tools/cloud-scale-bwamem$ cat compile.pl #! /usr/bin/perlsystem "mvn clean package";chdir "./src";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "./main/jni_fpga";system "mvn package -PotherOutputDir";chdir "../a[详细]
基因数据处理47之ART基因序列数据生成器（仿真）

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：83

1.概念： ART基因序列数据生成器详细请见论文：【1】和官网【2】 2.下载： ART-bin-GreatSmokyMountains-04.17.16-Linux64.tgz http://www.niehs.nih.gov/research/resources/assets/docs/artbingreatsmokymountains041716linux64tgz.tgz 3.配置 sudo cp[详细]
基因数据处理49之cloud-scale-bwamem运行成功

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：164

副标题#e# 1.先使用art生成数据：请看前一篇 2.上传fastq到hdfs： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ spark-submit --class cs.ucla.edu.bwaspark.BWAMEMSpark --master local[2] /home/hadoop/xubo/tools/cloud-scale-bwamem-0.[详细]
基因数据处理48之ART使用实例

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：99

副标题#e# 相关参数请见上一篇 1.使用实例1： hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$ art_illumina -ss HS20 -i GRCH38chr1L3556522.fna -l 100 -f 20 -o G38L100F20Nhs20 ====================ART==================== ART_Illumina[详细]
求0至大数之间的随机数

所属栏目：[大数据] 日期：2021-03-06 热度：146

题目：给定一个String类型的大数(非负整数)，不能直接转化为Integer，类似如下要求 The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is?NOT?allowed. You should?NOT?use internal library such as?B[详细]
Multiply Strings ---leetcode

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：197

Given two numbers represented as strings,return multiplication of the numbers as a string. Note: The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is?NOT?allowed. You should?NOT?use interna[详细]
大素数测试和大数素因子分解

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：148

小黄书第１９章p82页根据合数的拉宾－米勒测试可得到素数的必要条件。参考资料。以POJ1811 Prime Test 为例。 #includestdio.h#includemath.h#includestdlib.h#includealgorithmusing namespace std;typedef long long LL;const int S=20;LL pfact[10005[详细]
从人性出发，5步挖掘用户需求

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：157

副标题#e# 做一个产品之前，常常最要做的就是挖掘用户的需求。也有了那些用户调研，市场分析，竞品分析等等，最后落地成产品功能。很多大拿都说过，要满足人性七宗罪等。但往往落实下来很难，感觉很虚，作者也迷茫了一段时间。恰巧这次美团架空了大众点评的[详细]
数据处理的两个基本问题

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：99

第八章? 本章概述: 1.?????????计算机是进行数据处理、运算的机器，那么有两个基本的问题就包含在其中: 1）??处理的数据在什么地方？ 2）??要处理的数据有多长？这两个问题，在机器指令中必须给以明确或隐含的说明，否则计算机就无法工作。 2.?????????我[详细]
如何将机器学习技术应用到文本挖掘中

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：73

本挖掘典型地运用了机器学习技术，例如聚类，分类，关联规则，和预测建模。这些技术揭示潜在内容中的意义和关系。文本发掘应用于诸如竞争情报，生命科学，客户呼声，媒体和出版，法律和税收，法律实施，情感分析和趋势识别。在本篇博客帖中，你将会学习到[详细]
述符有多好和在特殊情况下如何考虑相似性等问题

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：174

http://bb.iyaya.com/linyifan2006/riji-14417556.html http://bb.iyaya.com/2007121/riji-14417521.html http://bb.iyaya.com/132618hh/riji-14417543.html http://bb.iyaya.com/438586550/riji-14417544.html http://bb.iyaya.com/53231288/riji-1441754[详细]
大数据分析技术生态圈一览

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：141

大数据分析技术生态圈一览人人都说大数据，但很多人对这个领域并非真正地了解。为了帮助你，我们决定制作这份厂商图标和目录。它并不是全面列出了这个领域的每家厂商，而是深入探讨大数据分析技术领域。我们希望这份资料新颖、实用。作者：来源：网络|[详细]
医疗行业大数据应用案例（华大基因、大数据预测早产、大数据调配

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：179

文章从华大基因推出肿瘤基因检测服务、大数据预测早产儿病情、广东省人民医院利用大数据调配床位3个医疗行业大数据应用案例中，以应用背景、数据源、图说场景、实现途径、应用效果5个视角去看待大数据在医疗的应用状况。案例一：华大基因推出肿瘤基因检测[详细]
搭建大数据处理集群（Hadoop，Spark，Hbase）

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：185

副标题#e# 搭建Hadoop集群配置每台机器的 /etc/hosts保证每台机器之间可以互访。 120.94.158.190 master 120.94.158.191 secondMaster 1、创建hadoop用户先创建hadoop组 sudo addgroup hadoop 然后再建一个hadoop用户加入到hadoop组，（前一个为组，后一[详细]
【杭电oj】1715 - 大菲波数（大数递推）

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-28 热度：114

点击打开题目大菲波数 Time Limit: 1000/1000 MS (Java/Others)????Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others) Total Submission(s): 17138????Accepted Submission(s): 5689 Problem Description Fibonacci数列，定义如下： f(1)=f(2)=1 f(n)=f(n-1)+f([详细]
数据处理---Spring Batch之基础

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-27 热度：137

? ? ? Spring框架提供了强大的底层结构，基于此，Spring出现了很多方面的应用。Spring Batch就是其一，它是一个轻量级的，完全面向Spring的批处理框架，可以应用于企业级大量的数据处理系统。Spring Batch以POJO和大家熟知的Spring框架为基础，使开发者更[详细]
数据处理---Spring Batch之实践

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-27 热度：152

副标题#e# 上面介绍了Spring Batch的基本概念和简单的demo项目，显然这些还是不够实际使用的。下面我们来更多的代码实践。 ? ? ? ? 在上面的基础项目上面，我们来更多的修改： ? ? ? ? 不用项目默认的hsql DB，用mysql,让ItemReader,ItemWriter 支持mysql；[详细]
Pentaho BI Server的启动过程详解（二）

所属栏目：[大数据] 日期：2021-02-27 热度：78

时隔好久现在接着上一篇来继续聊一下Pentaho BI Server的启动过程，今天主要讲的就一个类PentahoSystem。软件版本 Pentaho BIServer 5.0.1-ce 关于PentahoSystem 在上一篇文章里已经介绍过在SolutionContextListener中当应用启动时分调用PentahoSystem的i[详细]

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